明確旋轉蒸發儀的所需完成的蒸餾任務蒸餾效率很關鍵，旋轉蒸發儀的蒸餾效率決定了每天能蒸餾的樣品個數，在相同溶劑的情況下，蒸餾效率越高，蒸餾的樣品個數也越多。如果樣品量大，在蒸餾效率上需要多花心思進行考量。

 
以下總結幾種影響蒸餾效率的關鍵因素：

1、系統的真空值
旋轉蒸發儀的密閉空間由蒸發瓶、蒸發管、密封圈、冷凝管等玻璃組件、真空緩沖瓶、真空泵和真空管路組成，而這其中，影響系統真空的關鍵是會變化的因素：真空泵、密封圈和真空管。真空泵和真空控制器：真空泵極限越低，系統的真空值也越低。在蒸餾的時候，需要通過真空控制器設置合理的真空值，保證蒸餾效率，同時避免爆沸。密封圈：作為承接蒸發管和冷凝管的關鍵密封件，其耐磨性和耐腐蝕性是關鍵。PTFE和橡膠常被用作密封圈的材質，顯然PTFE的耐磨性和耐腐蝕性都會更好。

2、加熱鍋溫度
加熱鍋溫度越高，溶劑的蒸餾效果越快，但考慮到目標成分的熱敏性、操作的安全性，最常用的溫度是60℃。或者80°C以上，改用硅油作為介質會帶來清潔的問題，一般更建議降低真空值來達到更快的蒸餾效率。

3、蒸發瓶的轉速
蒸發瓶的轉速越快，瓶內表面浸潤面積越大，受熱面積越大；但同時液膜厚度也越厚，增大傳熱溫差。對于不同粘度的物料，存在很好的轉速。且轉動動力由馬達提供，市面上直流無刷馬達、交流馬達和步進馬達都有，參差不齊，直流無刷馬達的反饋是很好的，10年免維修維護。

4、冷卻介質的溫度
為確保好的蒸餾效率，冷卻介質一般建議同加熱鍋溫度保持40°C的溫差，以便將熱蒸汽進行快速冷凝，降低蒸汽對系統真空的影響。安全風險評估蒸餾的安全風險主要來源于蒸餾的溶劑和加熱介質。